Попробуйте откинуть спинку заднего сидения, взять переноску (подсветку),закрыть багажник и попросить кого-нибудь поливать на заднее стекло и багажник а самому смотреть откуда поступает вода. Может через крепление антенны заливать. Но для начала можно открыть сливную резиновую пробку под запаской. Может уплотнитель крышки плохой, может где-то сварной шов не промазан мастикой.
В общем, делается так: снимаете пластмасовые боковины в багажнике, со стороны антенны. Откручиваете антенну от металической стойки. Откручиваете пластмасовую гайку, которая держит антенну сверху. Снимаете антенну. Вырезаете из резины прокладку с дыркой, одеваете на резьбовую часть антенны и собираете в обратном порядке, чтобы прокрадка осталась внутри кузова.